疗技术落后，检疫靠肉眼观察，治疗凭经验诊断，难以正常开展防疫、检疫工作；无交通工具，而目前我县农村畜禽养殖主要是千家万户分散饲养，面广量大，基层兽医站缺乏必要的交通工具，限制了其服务范围及质量；办公经费不足，无法为养殖户服务提供便利服务，在一些乡镇，当地老百姓把兽医站工作人员戏称为：“远看像要饭的，近看像烧炭的，仔细一看原来是兽医站的。”
（五）动物防疫监督管理工作尚不到位。有的基层执法人员素质不高，不敢执法、不善执法，对拒免、拒检、拒缴免检费的不能依法处理，使一些未检动物及产品流入市场。检疫执法难度大，巿场检疫中个体商贩的素质参差不齐，故意刁难检疫人员和暴力抗检的现象屡有发生，检疫部门在一定程度上较难取得其他执法部门的大力协助，又无执法服装，最终导致市场检疫困难重重。
（六）《动物防疫法》存在的问题。
1、机构设置上存在问题。《动物防疫法》至今颁布实施6年多，动物防疫监督机构的设置仍然没有一个统一的格式，有的防治、动检、监督各自单设；有的其中两者合设。在单位名称上也各不相同，在单位性质上有的为全额事业单位，有的为差额事业单位，还有的为自收自支事业单位，也有少数归行政系列。这些不统一性已严重影响了动物防疫、检疫、监督工作的正常开展，在职能划分上没有一个明确的规定，开展工作各自为政，甚至互相扯皮，本来是统一的法律，由于没有统一健全的机构和执法队伍，造成监管不力、工作的混乱，损害了防疫执法的形象。
2、《动物防疫法》规定，国家对严重危害人体健康和养殖业生产的动物疾病实行计划免疫，实施强制免疫。但强制免疫造成的损害缺乏应有的赔偿保障机制，在实际工作中，补偿给畜民的补偿费严重偏低，导致畜民拒绝免疫现象时有发生。
3、《动物防疫法》没有把如宠物防疫、禽蛋检疫等没有纳入动物防疫范围。对无《动物诊疗许可证》从事动物诊疗活动无处罚规定，尽管规定对兽医从业人员实行资格考试，对从业活动实行许可证制度，但由于《动物防疫法》对无证从业活动如何查处和追究没有规定法律责任，动物诊疗管理秩序始终无法建立和维持。
4、《动物防疫法》对大量存在的违法行为处理力度过低或无处罚措施。《动物防疫法》第46条规定的3种违规行为没有罚款规定，处理力度太低，违法行为人对处理费用由自己承担的规定不屑一顾。在实际工作中，造成了拒绝免疫、不按程序免疫，不按规定清洗消毒动物运载工具、垫料、包装物，不按规定处置染病动物及其排泄物、病死动物尸体的情况大量发生，严重影响了动物防疫工作更好地开展。第49条规定对拒检、逃检的违法行为没有处罚规定，动物防疫监督机构在查处此类违法行为时，只能补检，而不能惩处，缺乏打击手段和力度，致使拒检、逃检、转移、销售染疫动物（动物产品）等现象多次发生。第3条解释了动物是指家畜家禽和人工饲养、合法捕获的其他动物，并没有明确解释种用动物及非种用动物，从外省购进仔猪、禽苗等进行饲养一段时间后卖出屠宰是不是种用动物？
5、《动物防疫法》和《动物检疫管理办法》对检疫程序和检疫票证填写上没有明晰，如在出县境检疫上要明确“出县境动物产品检疫合格证明”上的有效期（本证自签发之日起xx日内有效）是指为运输期间的有效期，还是整个检疫行为的有效期？当检疫员开展检疫工作结束后，但经营户拒绝交检疫费或少交费时如何处罚？
6、《动物防疫法》对个人瞒报动物疫情无处理措施，一些个体兽医，隐瞒动物疫情，留病养医，扰乱动物防疫工作秩序，造成动物疫病扩散、流行。
7、在实际工作中，按照《动物防疫法》的规定应追究动物防疫违法人
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