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这次大会的主要精神集中体现在各项报告和通过的各项决议中。
一、政府工作报告的主要精神
听取和审议司马义·铁力瓦尔地主席所作的政府工作报告是本次大会的一项重要议题，代表们在审议中普遍认为，报告全面客观、实事求是地总结了2009年自治区各项工作所取得的成就及存在的问题，提出了2009年工作的总体要求和具体措施，充分体现了党的十六届四中、五中全会精神，表达了全区各族人民的意愿，代表们对报告表示满意。
报告首先回顾了2009年工作，司马义·铁力瓦尔地主席在报告中说：2009年是“十五”时期的最后一年，也是新疆维吾尔自治区成立50周年。一年来，在自治区党委的正确领导下，我们坚定不移地贯彻执行以胡锦涛同志为总书记的党中央的路线、方针、政策，团结带领全区各族干部群众，坚持以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真落实党的十六大、十六届四中、五中全会和自治区党委六届八次全委（扩大）会议精神，以科学发展观统领全局，扎实工作，开拓创新，努力解决发展中出现的新矛盾、新问题，国民经济持续快速健康发展，社会事业全面进步，人民生活不断改善，社会政治大局保持稳定。预计全年生产总值2680亿元，比上年增长10.9%。2009年取得的成绩为做好2009年的工作，顺利实施“十一五”规划奠定了坚实基础。
司马义·铁力瓦尔地主席在报告中指出，2009年，自治区人民政府主要抓了10个方面的工作：1、高度重视“三农”工作，千方百计促进农牧民增收；2、坚持实施优势资源转换战略，积极推进新型工业化；3、优化政策环境，推动第三产业和非公有制经济加快发展；4、加大投入力度，加强基础设施和生态环境建设；5、发挥地缘优势，努力扩大对内对外开放；6、增强财政调控能力，确保金融平稳运行；7、实施科教兴新战略，大力发展各项社会事业；8、坚持以人为本，切实为各族群众办实事办好事；9、加强民主法制，维护社会稳定，促进和谐社会建设；10、兵团经济快速发展，维稳戍边能力明显增强。
报告在肯定成绩的同时，也提出了工作中存在的一些突出矛盾和问题。主要是：结构性矛盾依然存在，促进经济增长方式转变的任务艰巨；农牧民增收难度大，城乡区域发展不平衡，工业化、城镇化水平不高；财政收支矛盾仍然突出；就业再就业形势严峻；一些关系群众切身利益的问题亟待解决；安全生产形势不容乐观；维护社会稳定的任务依然繁重。
关于2009年的工作，报告指出：2009年是实施“十一五”规划的开局之年，做好2009年工作的意义重大。2009年自治区经济社会发展总的要求是，以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，认真贯彻党的十六大、十六届五中全会、中央经济工作会议和自治区党委六届十次全委（扩大）会议、自治区经济工作会议精神，以科学发展观统领经济社会发展全局，推动经济社会发展切实转入科学发展轨道，进一步做好“三农”工作，加快实施优势资源转换战略，深化改革，扩大开放，推进经济结构调整和经济增长方式转变，提高经济增长的质量和效益，加大基础设施建设力度，大力发展各项社会事业，着力解决好关系人民群众切身利益的突出问题，不断提高人民生活水平，促进和谐社会建设，为顺利实施“十一五”规划开好局、起好步