。审计是国家经济社会运行“免疫系统”理论，是新任审计长刘家义总结审计机关25年实践经验，凝聚中外审计理论创新成果所倡导的审计新理念。核心是以科学发展观为灵魂和指南，准确把握经济社会发展趋势和审计发展规律，统筹考虑二者之间的内在联系，更好地发挥保障国家经济社会健康运行的“免疫系统”功能。这种功能主要体现在三个方面：一是预防功能。作为一种制度安排，国家审计具有内生性的威慑作用，要充分发挥其对影响经济社会健康运行的各种“病害”的抑制作用。要充分发挥审计独立、客观、公正、超脱、涉及社会各方面的优势，及时发现苗头性、倾向性问题，及早感受风险，提前发出警报，起到预警作用。二是揭露功能。审计的首要职责是监督，监督就必须查错纠弊，要坚决查处违法违规、经济犯罪、损失浪费、奢侈铺张、损坏资源、污染环境、损害人民群众利益、危害地区经济安全等各种行为，并依法进行惩戒，同时揭示体制障碍、制度缺陷、机制扭曲和管理漏洞，以保障经济社会运行的安全健康。三是抵御功能。审计要从微观到宏观、从个别到一般、从局部到全局、从苗头到趋势、从表象到内在，进行深层次分析、揭示和反映，防止消极因素入侵整个经济社会系统，促进改革体制、健全法治、完善制度、规范机制、强化管理、防范风险，提高经济社会运行质量和绩效，增强经济社会运行的“免疫力”，推动经济社会全面协调可持续发展。
第二，推进审计方式转型。由过去主要进行事后审计向事前和事中审计转变，加大审前调查力度，积极探索跟踪审计方式，对大型投资项目和重大民生工程实施跟踪审计，努力在发挥预防、揭露和抵御作用上下功夫；要组织开展审计项目的后续审计，进一步加强对审计决定落实情况的追踪检查，建立健全问责机制和责任追究制度，提高审计成果的利用率。要坚持多种审计类型和审计方法的有机结合，使有限的审计资源得到更加有效的利用。
第三，全面加强审计质量控制。要建立和完善审计质量控制体系，加强审计计划管理，科学制定全年审计项目计划，增强计划的科学性和可行性；加强对审计方案编制、组织实施、审计报告、处理处罚各环节的质量控制，提高审计规范化水平。强化审计人员的责任意识和质量意识，严格执行《审计法》和审计署6号令。健全审计项目审理复核制度，实行审计实施方案和审计报告的“集体审定制度”，公开公正审理和评价审计项目，将审理会的意见作为评价审计项目质量的重要依据。加强审计质量检查和优秀审计项目评选工作。坚持审计质量责任追究制度，把责任的重点放到一线审计组和审计人员身上，明确各环节责任，实行全过程控制审计质量。建立健全激励机制，把审计质量作为科室和个人综合考评重要内容。
第四，有效整合和科学利用审计资源。按照全市审计“一盘棋”和“不求所有、但求所用”的原则，打破市、旗县区和各业务科（股）界限，在全市审计系统甚至更大范围整合审计资源，吸收聘用各行政、事业单位或社会上的会计、工程专业人才，统一调配审计力量，统一安排和编组，对重点行业和重点项目进行审计。形成以项目为中心，纵横结合、上下联动、信息共享的工作机制，发挥整体合力，不断提高审计效率，提升审计工作层次和水平。对旗县区重大审计项目实行市级统筹，每个旗县区每年至少安排5个项目报市局统一组织，实行上审下或交叉审。
第五，积极推进绩效审计。学习借鉴先进地区经验，积极组织开展绩效审计。注重从政策执行、资金使用、资源利用等方面综合分析审计项目的效率、效益和效果。采用网络调查、发放调查问卷、召开座谈会等方法，广泛征集社情民意。将2009年确定为全市 “绩效审计推进年”，市、县两级审计机