一是部分农民疾病风险意识淡薄，没有未雨绸缪的忧患意识和风险控制的保险意识，参合积极性有待提高。二是有的农民现实心理较强，交了参合费但没得过病，觉得吃亏，下一年就不愿意再交钱。还有的农民期望值过高，认为入了新农合不管合不合规范，什么都要求报销，达不到自己的要求就不满意，对农合政策进行反宣传，因而动摇了一些农民的参合信心。三是有外出打工人员的家庭参合率低。在外务工人员患病不能回本市就医，而新农合制度规定以户为单位，按户参合，不允许分户单人参合。四是遵循“农民自愿”的原则，对怀疑和不理解农合政策的农民没法强制要求参合，只能做宣传动员工作。
2、宣传力度不够。虽然通过各种方式进行了宣传，但调查走访发现，许多农民只知道新农合政策，但对其制度以及参合人的权利、义务、药费报销和管理办法等具体内容知晓率不高，个别农民甚至存在误解，把新农合等同于过去的合作医疗或一般的商业保险，没有认识到这是国家的一项惠民政策。
3、区内定点医疗机构医疗行为不够规范，基础设施、医疗水平和服务能力还不能完全满足新农合工作的需要。新农合制度要求：农民就诊小病不出镇，大病不出区，疑难复杂病到市级以上医院治疗。但从我区运行情况看，一些可以在镇卫生院治疗的常见病、多发病大量涌入市级医院。一些可以在区级医院治疗的疾病却转到市、省级医院。其原因：一是区内定点医疗机构存在基础设备陈旧、经费短缺、专业技术人员匮乏、医疗技术水平有限等问题。这些问题的存在不能与新农合制度完全接轨，这是导致农合患者外流的主要原因。二是区内定点医疗机构的诊疗行为不够规范：有的医务人员不写病志、不开处方、不填门诊日志等现象仍然存在；个别定点医疗机构还存在诊疗环节不透明等问题；少数医疗机构和医务人员核对卡证不细，审查把关不严，填写卡证不实，给农合基金运行带来了风险，某种程度上降低了定点医疗机构自身的信誉；三是我区地处近郊，交通便利，这也是患者外流不可忽视的客观原因。
4、农民反映的具体问题有三个：一是药价高。认为定点医疗机构的药价高于其他药店，按比例报销后，得到的实惠不是很多。二是患者在市级医院住院的医药费予以报销，门诊花费不报，而农民多数是在门诊就诊，此问题意见较大，希望执行以往的医药费报销制度。三是按农合管理中心的规定，患者必须在出院后八天内的星期三和星期四两个工作日到农合中心报销医药费，时间仓促，希望增加报销医药费的工作日。经与区卫生局沟通，问题的情况如下：关于药价问题：农合管理中心是代表全区定点医疗机构统一从正规的医药供应渠道进药，要求定点医疗机构按规定加价15％售出；关于医药费报销问题：新的农合医药费报销制度是20*年市里出台的新规定，取消市级医院门诊药费报销项目后，大幅度提高了在市级医院住院费的报销比例，体现了大病统筹原则，同时将区级医疗机构门诊药费的报销比例，从15％提高到了20％，目的就是促使农民小病不出区，让农合资金尽量消化在区级医疗机构；关于报销时间问题：目前，区卫生局已取消了医药费报销时限，规定年度内发生的医药费在本年报结。
三、对完善新型农村合作医疗制度的几点建议
1、加大宣传力度，为新农合工作长远发展奠定基础
一是根据农村群众生活方式、文化水平的特点，将经常性宣传与集中性宣传相结合，将新农合知识的宣传与健康教育宣传相结合。采取多种形式把党和政府惠及农民群众的新农合，全面准确及时有效地宣传好，使之家喻户晓。要利用发生在身边的生病得资助、无病保平安的典型事例引导群众，帮助群众树立卫生保健