入企业对其产供销各环节进行全面解剖分析。鉴于纳税人会计核算水平和某些主观故意，对其提供的有限的纳税资料进行评估，纳税评估效果不明显。并且纳税评估文书和程序对业务素质不高的基层税收治理员来说很难把握，致使纳税评估工作开展的不深入。因此，新的税收治理员制度要求我们不能只坐在办公室，对纳税人情况仅通过申报表、会计报表以及征管软件中的申报率、入库率、发票购销等已成型的静态信息来了解，必须走出去治理，深入到纳税人的生产经营场所了解情况，深入到与纳税人有关联往来的业户和单位全方位的把握其经营状况，对纳税人的原材料、生产情况、营销状况等购销存情况做到心中有数，为准确地分析和猜测税源提供有力的保障。
四、人员配置存在不合理现象，税收治理缺乏针对性和实效性。随着税收执法质量的提高及税收治理员制度的推行，税收治理员的业务需求越来越高，工作量越来越大，往往业务棒的青年都被调到市局或区局局机关有关科室，这样就造成了行政治理人员与基层分局一线人员比例不合理，使业务骨干不能正常发挥应有的作用，基层分局严重缺乏综合型人才。建议将拔尖人才充实到税收基层。目前，分局由于严重缺乏综合型人才，在人员力量分布和税源结构配比上，普遍存在人员倒挂现象，即：10％左右的治理员去负责占税收总量90％的税源治理，90％左右的治理员去负责占税收总量10％的小规模纳税人,小规模纳税人非凡是个体户数多，分布广，税源零星分散，耗费了大量的治理力量。许多治理员满足于户数清，不善于总结发现问题和寻找解决问题的办法，对税收治理缺乏深层次的思考和探索。形成了小税源相对精细化治理，大税源粗放式治理的不利局面，造成税收成本增加，税源监控水平下降。
五、目前虽然信息化程度较高，基层税收治理员达到了“一人一机”，但由于基层税收治理员业务素质偏低，对信息应用水平偏低，70的税收治理员不能进行数据处理分析应用，更不能实现信息数据的增值利用，造成税源治理被动。
六、在征管质量考核中个别指标考核不合理。非凡是区局对五个分局的延伸考核，应根据管户多少抽取同样的比例纳入考核，并且对五个分局要考核共有的指标。这样才具有可比性、合理性。
七、竞争激励机制有待进一步完善。上级一再提倡向基层倾斜，但最终落实的是向基层倾斜了工作量、责任及风险，待遇等并没有倾斜，严重影响了税收治理员的工作积极性，久而久之能级治理、考核机制将成为一纸空谈，所以竞争激励机制有待进一步完善。
八、个体税源治理难度较大。主要一是个体户籍把握“准确率”不能达到100，漏征漏管问题不同程度存在。二是个体定税临界点把握的依据不足，造成临界起征点业户未能及时纳入起征点以上核定征收税款。