个支付系统运行比较顺利。但是，随着支付业务量的逐步增加和支付范围的扩大，国库集中收付在操作过程中也渐渐凸现出其不容忽视的一面，这也正是我们今后工作应该努力的方向。
首先，加强对财政制度改革的政策宣传和业务流程培训是基础。公共财政框架下的财政国库制度改革是一项庞大的系统工程，改革的覆盖面广、工作量大，对操作人员的业务素质、微机熟练程度要求高，是一项全新的业务，整个工程涉及到基层预算单位、主管部门、财政部门、代理银行、人民银行、收款人等多个单位或个人，而自全省推行这项改革以来，从上到下缺乏系统的、规范的、专业的培训，特别是到县这一级，除开少数业务单纯的行政单位在运用中能得心应手外，多数是下设数个二、三级单位或基层站（所）的主管部门，这种管理职能延伸面宽、收入支出、往来款项、代扣代缴资金业务频繁的部门，在国库集中收付这个绝对程序化的系统中，对操作中遇到的实际问题茫然无措，没有可借鉴的完整模式得以合理解决。同时，新的国库收付制度从根本上打破了单位过去现金收支的随意性，使单位用钱与过去相比显得“不方便”，对改革带来的规范化要求短时期内不适应，特别是现在正处于改革的过渡期，银行、财政、单位等各环节的业务衔接还不是十分到位，软件也处于逐步完善阶段，不免引起少数单位的反感。那么，作为占改革主导地位的财政部门，能够有组织有计划、专人负责对整个国库系统业务人员的培训显得十分重要。一是从宣传政策、营造舆论声势出发，改变单位负责人和财务人员的认识观念，使之从传统的模式中蜕变出来，从理解到接纳改革所带来的业务变化；二是对系统业务操作流程进行指导，搞好跟踪服务，使经办人员能熟练地掌握系统软件，随时有问题随时解决，使之尽快在改革的大环境中进入角色，解除他们的后顾之忧，为国库集中收付的顺利推进铺就一条软环境通道。
其次，细化预算编制，全面推行内容完整、项目明细、定额科学、程序规范的部门预算是关键。国库集中收付制度是预算执行的过程，预算执行必须以科学规范的预算编制为基础。我县是全省29个贫困县之一，经济基础薄弱，地方自有财力小，预算单位之间因职能、人员、财力等因素的差异，所列支的范围和标准也不尽相同，那么在具体操作中就应该遵循定项目、定额度、定标准的编制要求，最大限度地平衡单位之间的人均支出水平，真正体现出公开、公平、公正的原则。在预算计划执行中，国库集中收付系统要求严格按部门预算为依据，只有部门预算细化到每笔支出项目，单位才能按月报出相对准确的用款计划，财政才能按部门预算编制审定计划的可行性，最终达到预算编制与预算执行相吻合。
再次，科学编制财政预算，钢化预算执行是保证。随着部门预算的实施，按照预算编制要求，部门预算必须经过“二上二下”的程序，首先由财政部门按照统一标准审核预算草案，再报同级人大常委会讨论通过后执行，是一套严密的具有法律效率的预算执行文本。对预算单位而言，部门预算就是单位一年间所有收支活动的“明细账”；对财政而言，部预算就是预算执行的“指标单”，钢化预算执行、杜绝资金拨付的随意性是维护预算严肃性的唯一途径，也是顺利实施财政预算的根本保证。