2、后续服务长效机制不完善。后续服务是农村沼气健康运行的保障，同时优质的后续服务也是农村沼气推广的基础。目前，我县虽然已建立沼气服务网点28个，并且已购置沼气检测仪、维修工具等沼气服务器具28套及相应的技术服务人员。但是，正真实施起来难度大，没有专用经费或多余的经费来支付服务网点的正常开支。例如：农户需换一个2元钱的沼气零件，而离服务网点有20里。如果技术人员上门服务即使2块钱的零件向农户收4块，也不够来回的路费，何况还有技工的误工费。这样就会出现，虽有服务网点而服务不到位。农民觉得修一小小的零件，就要花大本钱不划算，自然而然就影响了农户的建池积极性，因而维持服务网点的正常运行需一定的外来经费。后续服务长效机制，成为农村沼气推广的关键。
3、项目的申报户和实际建池户存在不相符。农村沼气国债项目申报与具体实施相差一段时间，在项目实施时会出现实际建池户与申报农户不相符，有的甚至不在同一个村内。这给国债项目验收带来一定困难，直接影响了农村沼气推广工作。近年来农村人口流动量很大，异地开发、异地转移，有的为了给小孩找一所好一点的学校，远离家乡在城郊的农田大棚种香菇、木耳等。这些原因直接造成申报农户与实际建池户不相符。给项目实施带来一定的困难，制约着农村沼气的推广速度。
4、建池成本的相对不均。因各项目户所处的位置不同，虽然得到政府的补贴是一样的但建池原材料的成本却相差极大，而乡村里又拿不出相应的配套资金。这就会出现虽有满腔的建池热情，却望而却步，农户无法承担过多的自筹资金，极大阻碍了农村沼气推广。据调查，在云和镇范围内3立方的沙子、石子各一车需500元，而在黄源、云丰、大湾、沙铺等乡镇每车砂石料将增加200元的运输成本，特别是像黄源乡水坳头村，每户建一沼气池（包括三改）需拿出4500元左右，减去政府补贴1300，农户自筹3200元，村里的经济薄弱无法拿出来补贴。与云和镇农户相比建一沼气池相差1000多元，因此有些农户只能望而叹兴。
5、三沼综合利用率低。当前农户只知道使用沼气，觉得方便、能省钱，而往往忽略了沼液、沼渣的利用，让上好的有机肥白白浪费掉，没有显示出沼气的综合效益，达不到推广的初衷，同时挫伤了农民建池的积极性。究其原因有二，一是农民对沼气的认识不够。农村户用沼气以“一池三改”为主。圈栏、厕所、厨房的生产、生活污水都进入沼气池，认为经过沼气池的肥料浓度被冲淡而不去利用，这就打破了农民原来用厕所的人粪尿来当有机肥来使的习惯。其实沼液、沼渣的氮、磷、钾含量非常丰富，而且具有防病防虫的效果。从技术的角度上讲，只有勤出料勤进料，完成池内循环，产气才正常，如果只进不出，池内就很少有储气空间造成供气不足。二是缺少相应的农产品基地。农村沼气不仅给农民带来上好的有机肥，而且数量要比平时多几倍，这就需要相应的农产品基地来消化，完成养殖—沼气—种植的循环。
四、几点建议
农村沼气推广建设工程是一项利国利民的好事，如何将好事办好，让农民群众切切实实得到实惠，需要从以下几个方面加以注意。
1、提高认识。要把发展农村能源统一到中央一号文件精神上来，要把发展农村能源作为推进社会主义新农村建设的重要内容，要把发展农村能源作为农村经济结构调整，促进农业增效，农民增收的重要途径，进一步创新工作思路，强化措施，务求实效。通过农村能源建设，引导农民改变传统的生产、生活方式，努力提高农民生活质量和农村文明程度，实现家居环境清洁化，农业生产无害化，